WordPress 3.9.1 のマイナーアップデートに伴い、テーマ Twenty Twelve1.4となりましたので、早速更新してみました。

特にPCで閲覧する上においては変化が見られませんでした。

ググッたら下記のようなページがありまして、1.3 から 1.4 への変更箇所のようです。
(違ってたら教えてね)

Changes from twentytwelve/1.3 at r34859 to twentytwelve/1.4 at r34859

CSS では a:hover の下に a:focus というのが加わえられています。

a:focus はキーボードで操作する人の為の配慮のようですね。

詳しくは下記サイト様のページを。

あまり日の目を見ないかわいそうな:focus擬似クラス